Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VOPP1Q96AW1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VOPP1Q96AW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VOPP1Q96AW1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms