Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TRIM52Q96A61 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TRIM52Q96A61 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
TRIM52Q96A61 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
TRIM52Q96A61 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TRIM52Q96A61 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms