Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC102AQ96A19 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC102AQ96A19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC102AQ96A19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC102AQ96A19 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC102AQ96A19 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms