Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXPE3Q969Y0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NXPE3Q969Y0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NXPE3Q969Y0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NXPE3Q969Y0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms