Protein–RNA interactions for Protein: Q969X1

TMBIM1, Protein lifeguard 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM1Q969X1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMBIM1Q969X1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMBIM1Q969X1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMBIM1Q969X1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms