Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HLA-CQ95604 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HLA-CQ95604 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HLA-CQ95604 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HLA-CQ95604 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms