Protein–RNA interactions for Protein: Q92935

EXTL1, Exostosin-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL1Q92935 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL1Q92935 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXTL1Q92935 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EXTL1Q92935 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL1Q92935 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms