Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GATA6Q92908 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GATA6Q92908 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GATA6Q92908 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms