Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EDAQ92838 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EDAQ92838 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDAQ92838 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDAQ92838 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDAQ92838 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EDAQ92838 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDAQ92838 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EDAQ92838 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDAQ92838 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDAQ92838 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EDAQ92838 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EDAQ92838 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EDAQ92838 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDAQ92838 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EDAQ92838 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
EDAQ92838 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EDAQ92838 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDAQ92838 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDAQ92838 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDAQ92838 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDAQ92838 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDAQ92838 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EDAQ92838 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDAQ92838 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDAQ92838 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDAQ92838 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDAQ92838 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EDAQ92838 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EDAQ92838 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EDAQ92838 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDAQ92838 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EDAQ92838 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDAQ92838 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDAQ92838 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDAQ92838 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDAQ92838 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDAQ92838 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDAQ92838 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EDAQ92838 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EDAQ92838 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EDAQ92838 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
EDAQ92838 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EDAQ92838 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDAQ92838 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDAQ92838 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDAQ92838 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDAQ92838 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EDAQ92838 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EDAQ92838 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDAQ92838 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDAQ92838 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDAQ92838 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EDAQ92838 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDAQ92838 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDAQ92838 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EDAQ92838 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDAQ92838 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDAQ92838 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDAQ92838 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDAQ92838 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDAQ92838 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EDAQ92838 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDAQ92838 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDAQ92838 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDAQ92838 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EDAQ92838 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDAQ92838 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDAQ92838 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDAQ92838 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EDAQ92838 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDAQ92838 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDAQ92838 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EDAQ92838 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDAQ92838 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDAQ92838 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EDAQ92838 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDAQ92838 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDAQ92838 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDAQ92838 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EDAQ92838 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EDAQ92838 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EDAQ92838 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDAQ92838 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDAQ92838 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDAQ92838 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDAQ92838 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EDAQ92838 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDAQ92838 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDAQ92838 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EDAQ92838 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms