Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
P3H4Q92791 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
P3H4Q92791 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
P3H4Q92791 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms