Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PROX1Q92786 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROX1Q92786 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROX1Q92786 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms