Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC9A6Q92581 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC9A6Q92581 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC9A6Q92581 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC9A6Q92581 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms