Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
IGDCC4Q8TDY8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IGDCC4Q8TDY8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IGDCC4Q8TDY8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IGDCC4Q8TDY8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms