Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UBA3Q8TBC4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBA3Q8TBC4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBA3Q8TBC4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBA3Q8TBC4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms