Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
KLHDC4Q8TBB5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
KLHDC4Q8TBB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
KLHDC4Q8TBB5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
KLHDC4Q8TBB5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms