Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW4

CCL4L1, C-C motif chemokine 4-like, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4L1Q8NHW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCL4L1Q8NHW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCL4L1Q8NHW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CCL4L1Q8NHW4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCL4L1Q8NHW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms