Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KNL1Q8NG31 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNL1Q8NG31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNL1Q8NG31 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNL1Q8NG31 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms