Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELBQ8NG08 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELBQ8NG08 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
HELBQ8NG08 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
HELBQ8NG08 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
HELBQ8NG08 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
HELBQ8NG08 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
HELBQ8NG08 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
HELBQ8NG08 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
HELBQ8NG08 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms