Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU1

BEST2, Bestrophin-2, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST2Q8NFU1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BEST2Q8NFU1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BEST2Q8NFU1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BEST2Q8NFU1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.5 ms