Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LPCAT1Q8NF37 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LPCAT1Q8NF37 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LPCAT1Q8NF37 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LPCAT1Q8NF37 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms