Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPATA4Q8NEY3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPATA4Q8NEY3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPATA4Q8NEY3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms