Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM3Q8NE01 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CNNM3Q8NE01 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms