Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EHBP1Q8NDI1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EHBP1Q8NDI1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EHBP1Q8NDI1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EHBP1Q8NDI1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms