Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACBD4Q8NC06 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACBD4Q8NC06 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACBD4Q8NC06 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms