Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
COLGALT1Q8NBJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
COLGALT1Q8NBJ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
COLGALT1Q8NBJ5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
COLGALT1Q8NBJ5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms