Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATG16L2Q8NAA4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG16L2Q8NAA4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATG16L2Q8NAA4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATG16L2Q8NAA4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATG16L2Q8NAA4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATG16L2Q8NAA4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms