Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZIC4Q8N9L1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ZIC4Q8N9L1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZIC4Q8N9L1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms