Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
DTX3Q8N9I9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DTX3Q8N9I9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms