Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLDN22Q8N7P3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CLDN22Q8N7P3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CLDN22Q8N7P3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms