Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LGI4Q8N135 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LGI4Q8N135 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LGI4Q8N135 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGI4Q8N135 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms