Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD4Q8IYR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMYD4Q8IYR2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMYD4Q8IYR2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD4Q8IYR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139 ms