Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC83Q8IWF9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC83Q8IWF9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCDC83Q8IWF9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCDC83Q8IWF9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms