Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXP4Q8IVH2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
FOXP4Q8IVH2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXP4Q8IVH2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXP4Q8IVH2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms