Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS6

RAB43, Ras-related protein Rab-43, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB43Q86YS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB43Q86YS6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB43Q86YS6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB43Q86YS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms