Protein–RNA interactions for Protein: Q86YP4

GATAD2A, Transcriptional repressor p66-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2AQ86YP4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GATAD2AQ86YP4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GATAD2AQ86YP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GATAD2AQ86YP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GATAD2AQ86YP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms