Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PHF13Q86YI8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PHF13Q86YI8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF13Q86YI8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms