Protein–RNA interactions for Protein: Q86W54

SPATA24, Spermatogenesis-associated protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA24Q86W54 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPATA24Q86W54 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SPATA24Q86W54 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPATA24Q86W54 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms