Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCNMB4Q86W47 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KCNMB4Q86W47 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNMB4Q86W47 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNMB4Q86W47 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms