Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ALYREFQ86V81 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALYREFQ86V81 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALYREFQ86V81 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms