Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW1

SLC51A, Organic solute transporter subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC51AQ86UW1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
SLC51AQ86UW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
SLC51AQ86UW1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SLC51AQ86UW1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SLC51AQ86UW1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SLC51AQ86UW1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms