Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6B7

SRGAP1, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRGAP1Q7Z6B7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRGAP1Q7Z6B7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRGAP1Q7Z6B7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SRGAP1Q7Z6B7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms