Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX20Q7Z614 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX20Q7Z614 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX20Q7Z614 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms