Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT27Q7Z3Y8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT27Q7Z3Y8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT27Q7Z3Y8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT27Q7Z3Y8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT27Q7Z3Y8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
KRT27Q7Z3Y8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT27Q7Z3Y8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT27Q7Z3Y8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KRT27Q7Z3Y8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KRT27Q7Z3Y8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms