Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CACNA2D4Q7Z3S7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CACNA2D4Q7Z3S7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CACNA2D4Q7Z3S7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms