Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUP54Q7Z3B4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP54Q7Z3B4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP54Q7Z3B4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms