Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM15Q7Z3B0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMIM15Q7Z3B0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMIM15Q7Z3B0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms