Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU52

KIAA0408, Uncharacterized protein KIAA0408, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0408Q6ZU52 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KIAA0408Q6ZU52 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KIAA0408Q6ZU52 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KIAA0408Q6ZU52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KIAA0408Q6ZU52 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms