Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM72Q6ZMU5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TRIM72Q6ZMU5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM72Q6ZMU5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM72Q6ZMU5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 242 ms