Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDZRN4Q6ZMN7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDZRN4Q6ZMN7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PDZRN4Q6ZMN7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDZRN4Q6ZMN7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms