Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMJ2

SCARA5, Scavenger receptor class A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA5Q6ZMJ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SCARA5Q6ZMJ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SCARA5Q6ZMJ2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SCARA5Q6ZMJ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SCARA5Q6ZMJ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 210.3 ms